Одним обычным утром, капитан армии США Колтер Стивенс просыпается в поезде, в то самое время, когда все люди спешат на работу. Все бы ничего, вот только он не помнит как попал в этот поезд и почему на руках у него чужие документы, а сидящая напротив девушка называет его Шоном? Отражение в зеркале свидетельствует о том, Колтер находится не в своем теле. И вскоре после этого поезд взрывается и гибнут все пассажиры.

Вдруг вспышка света и Колтер очнулся в темной комнате. «Где я?» – спрашивает капитан. «Внутри Исходного кода», слышится мужской голос. «Что такое Исходный код?» – пытается узнать Колтер.

Исходный код – это программа, которая позволяет перемещаться в тела других людей. За 17 минут до их смерти. Так будет повторяться снова и снова, пока Колтер наконец не разгадает загадку – кто взрывает поезд…